發電機非全相運行，一般在發電機并列、解列時，發電機出口斷路器合閘、分閘過程中發生主斷路器機構卡澀或分相操作的主斷路器一相甚至兩相油壓消失等情況中出現。
發電機非全相運行現象:
a. 主變高壓側三相電流指示不正常，斷開相電流指示為零。
a. 發電機定子電流三相嚴重不平衡。
b. 發電機負序電流表指示異常增大。
c. 發電機三相電流中兩相電流相等或近似相等，且僅為第三相電流的一半左右，應判斷為主變高壓側開關一相斷開，兩相接通。
d. 主變中性點地刀在合閘位置時，發電機三相電流中兩相電流相等或近似相等，而第三相電流為零或近似為零，或者中性點地刀在斷開位置時發電機三相電流為零或近似為零，應判斷為主回路兩相斷開一相接通。
e. 發變組中性點有零序電流(或零序電壓)。處理措施:
若發變組非全相保護及斷路器失靈保護動作，按停機處理。否則按下處理：
a. 立即將AVR切至手動運行
b. 發變組主回路有一相或兩相誤跳閘造成發電機非全相運行，應立即減發電機有、無功功率至兩不送狀態，將負荷電流限制在允許范圍內。
c. 未斷開發電機主開關前不得關閉汽機主汽門及斷開滅磁開關。
d. 發電機不對稱過負荷保護動作跳閘按事故停機處理
e. 并、解列時，發電機主開關非全相合上、斷開時，應迅速減發電機出力至兩不送狀態，斷開發變組主開關，若主開關不能三相斷開，應迅速匯報中調進行倒母操作，利用母聯開關使發電機與系統解列。
f. 發電機遭受負序電流沖擊后，經分析計算其I2t大于允許值，應抽出轉子進行詳細檢查。